MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acinetobacter baumannii ATCC 17978 plasmid pAB2

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009084	GA	3	6	3	8	50 %	0 %	50 %	0 %	126640110
2	NC_009084	ACTTAG	2	12	50	61	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126640110
3	NC_009084	AAC	2	6	65	70	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126640110
4	NC_009084	TTG	2	6	89	94	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126640110
5	NC_009084	ATCA	2	8	160	167	50 %	25 %	0 %	25 %	126640110
6	NC_009084	CG	3	6	228	233	0 %	0 %	50 %	50 %	126640110
7	NC_009084	A	6	6	253	258	100 %	0 %	0 %	0 %	126640110
8	NC_009084	CTG	2	6	350	355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640110
9	NC_009084	GAA	2	6	379	384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640110
10	NC_009084	TAG	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640110
11	NC_009084	TAG	2	6	423	428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640110
12	NC_009084	AGAA	2	8	511	518	75 %	0 %	25 %	0 %	126640110
13	NC_009084	AAAT	2	8	593	600	75 %	25 %	0 %	0 %	126640110
14	NC_009084	AGA	3	9	680	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640110
15	NC_009084	T	6	6	731	736	0 %	100 %	0 %	0 %	126640110
16	NC_009084	A	7	7	900	906	100 %	0 %	0 %	0 %	126640110
17	NC_009084	AAG	2	6	3211	3216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640111
18	NC_009084	CTAAAG	2	12	3322	3333	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126640111
19	NC_009084	AGG	2	6	3341	3346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126640111
20	NC_009084	CAA	2	6	3441	3446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126640111
21	NC_009084	TGC	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640111
22	NC_009084	AT	3	6	3539	3544	50 %	50 %	0 %	0 %	126640111
23	NC_009084	CAT	2	6	3594	3599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640111
24	NC_009084	GCA	2	6	3657	3662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640111
25	NC_009084	T	6	6	3810	3815	0 %	100 %	0 %	0 %	126640111
26	NC_009084	AGC	2	6	3839	3844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640111
27	NC_009084	TAGT	2	8	3871	3878	25 %	50 %	25 %	0 %	126640111
28	NC_009084	GCA	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640111
29	NC_009084	ATT	2	6	4000	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640111
30	NC_009084	A	7	7	4007	4013	100 %	0 %	0 %	0 %	126640111
31	NC_009084	GCT	2	6	4046	4051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640111
32	NC_009084	ATC	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640111
33	NC_009084	ATG	2	6	4357	4362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640112
34	NC_009084	TTA	2	6	4372	4377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640112
35	NC_009084	GCA	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640112
36	NC_009084	GAA	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640112
37	NC_009084	AAG	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640112
38	NC_009084	TGCA	2	8	4554	4561	25 %	25 %	25 %	25 %	126640112
39	NC_009084	GAT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640112
40	NC_009084	TCACAT	2	12	4620	4631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640112
41	NC_009084	TGG	4	12	4647	4658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126640112
42	NC_009084	TGC	2	6	4728	4733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640112
43	NC_009084	TCG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640112
44	NC_009084	CAT	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640112
45	NC_009084	AGC	2	6	4857	4862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640112
46	NC_009084	GCA	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640112
47	NC_009084	A	6	6	4982	4987	100 %	0 %	0 %	0 %	126640112
48	NC_009084	TCA	2	6	5071	5076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640112
49	NC_009084	TGG	3	9	5106	5114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126640112
50	NC_009084	TAAA	2	8	6201	6208	75 %	25 %	0 %	0 %	126640113
51	NC_009084	TAC	2	6	6277	6282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640113
52	NC_009084	TGA	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640113
53	NC_009084	ATTC	2	8	6434	6441	25 %	50 %	0 %	25 %	126640113
54	NC_009084	TAT	2	6	6472	6477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640113
55	NC_009084	AGGA	2	8	6486	6493	50 %	0 %	50 %	0 %	126640113
56	NC_009084	AAT	2	6	6515	6520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
57	NC_009084	GTG	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126640113
58	NC_009084	CAG	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640113
59	NC_009084	CTC	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126640113
60	NC_009084	AGA	2	6	6871	6876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640113
61	NC_009084	ATA	2	6	6975	6980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
62	NC_009084	ATG	2	6	7011	7016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640113
63	NC_009084	A	6	6	7099	7104	100 %	0 %	0 %	0 %	126640113
64	NC_009084	TAT	2	6	7115	7120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640113
65	NC_009084	ATTA	2	8	7145	7152	50 %	50 %	0 %	0 %	126640113
66	NC_009084	TCA	2	6	7174	7179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640113
67	NC_009084	ACT	2	6	7199	7204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640113
68	NC_009084	TC	3	6	7206	7211	0 %	50 %	0 %	50 %	126640113
69	NC_009084	TA	3	6	7313	7318	50 %	50 %	0 %	0 %	126640113
70	NC_009084	ATT	2	6	7320	7325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640113
71	NC_009084	T	6	6	7361	7366	0 %	100 %	0 %	0 %	126640113
72	NC_009084	ATA	2	6	7458	7463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
73	NC_009084	AAG	2	6	7488	7493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640113
74	NC_009084	ACC	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126640113
75	NC_009084	CAG	2	6	7517	7522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640113
76	NC_009084	ACTTT	2	10	7587	7596	20 %	60 %	0 %	20 %	126640113
77	NC_009084	A	6	6	7650	7655	100 %	0 %	0 %	0 %	126640113
78	NC_009084	TAA	2	6	7681	7686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
79	NC_009084	A	7	7	7707	7713	100 %	0 %	0 %	0 %	126640113
80	NC_009084	TAA	2	6	7714	7719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
81	NC_009084	AAGA	2	8	7851	7858	75 %	0 %	25 %	0 %	126640113
82	NC_009084	CTA	2	6	7902	7907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640113
83	NC_009084	AAT	2	6	7952	7957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
84	NC_009084	GAT	2	6	7982	7987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640113
85	NC_009084	TACT	2	8	8008	8015	25 %	50 %	0 %	25 %	126640113
86	NC_009084	TA	4	8	8033	8040	50 %	50 %	0 %	0 %	126640113
87	NC_009084	CTG	2	6	8121	8126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640113
88	NC_009084	CT	3	6	8185	8190	0 %	50 %	0 %	50 %	126640113
89	NC_009084	CCT	2	6	8309	8314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126640113
90	NC_009084	TGA	2	6	8347	8352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640113
91	NC_009084	ATA	2	6	8397	8402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
92	NC_009084	CA	3	6	8477	8482	50 %	0 %	0 %	50 %	126640113
93	NC_009084	AAT	2	6	8507	8512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
94	NC_009084	AT	3	6	8554	8559	50 %	50 %	0 %	0 %	126640113
95	NC_009084	GAA	2	6	8571	8576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640113
96	NC_009084	TTTAG	2	10	8579	8588	20 %	60 %	20 %	0 %	126640113
97	NC_009084	AGATA	2	10	8607	8616	60 %	20 %	20 %	0 %	126640113
98	NC_009084	T	7	7	8710	8716	0 %	100 %	0 %	0 %	126640114
99	NC_009084	A	8	8	8717	8724	100 %	0 %	0 %	0 %	126640114
100	NC_009084	T	8	8	8772	8779	0 %	100 %	0 %	0 %	126640114
101	NC_009084	AGA	2	6	8803	8808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640114
102	NC_009084	ATT	2	6	8874	8879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
103	NC_009084	AGC	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640114
104	NC_009084	TTAT	2	8	8927	8934	25 %	75 %	0 %	0 %	126640114
105	NC_009084	ATT	2	6	8953	8958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
106	NC_009084	CATTAA	2	12	8988	8999	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126640114
107	NC_009084	TTTTA	2	10	9001	9010	20 %	80 %	0 %	0 %	126640114
108	NC_009084	T	8	8	9055	9062	0 %	100 %	0 %	0 %	126640114
109	NC_009084	A	6	6	9073	9078	100 %	0 %	0 %	0 %	126640114
110	NC_009084	ATA	2	6	9090	9095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640114
111	NC_009084	ATTTT	2	10	9117	9126	20 %	80 %	0 %	0 %	126640114
112	NC_009084	T	6	6	9123	9128	0 %	100 %	0 %	0 %	126640114
113	NC_009084	ATT	2	6	9133	9138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
114	NC_009084	GAA	2	6	9152	9157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640114
115	NC_009084	T	8	8	9158	9165	0 %	100 %	0 %	0 %	126640114
116	NC_009084	TAT	2	6	9174	9179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
117	NC_009084	T	6	6	9179	9184	0 %	100 %	0 %	0 %	126640114
118	NC_009084	A	7	7	9190	9196	100 %	0 %	0 %	0 %	126640114
119	NC_009084	TAT	2	6	9197	9202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
120	NC_009084	CAC	2	6	9280	9285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126640114
121	NC_009084	GTATT	2	10	9291	9300	20 %	60 %	20 %	0 %	126640114
122	NC_009084	TGCT	2	8	9342	9349	0 %	50 %	25 %	25 %	126640114
123	NC_009084	T	6	6	9356	9361	0 %	100 %	0 %	0 %	126640114

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.